細胞凋亡通常稱為細胞程序性死亡，是由基因控制的主動性細胞死亡過程。越來越多數據發現，細胞凋亡與多種疾病密切相關，如癌細胞具有連續增殖、抵抗細胞凋亡能力，利用流式細胞儀分析細胞凋亡可為腫瘤診斷，療效評價和預后預測提供了重要的參考指標。然而很多實驗的同學們，常會碰到上機檢測時細胞死亡太多卻檢測不出凋亡，多次重復結果不一致等現象，接下來就一起看看如何把細胞凋亡的數據變的更加漂亮，準確！
首先，明確一下細胞凋亡和壞死的區別
細胞凋亡(apoptosis) 是一件主動性細胞死亡事件，它涉及一系列基因的激活、表達以及調控，是細胞為更好地適應環境而主動爭取的一種死亡過程。 具體表現為： 出芽形成凋亡小體、核小體間DNA的切割，凋亡小體被吞噬和消化等幾個連續過程等。
細胞壞死（necrosis） 則是一件被動的過程，是細胞受到強烈理化或生物因素作用引起細胞無序變化的死亡過程，即病理條件下，自體損傷的一種現象。 具體表現為： 細胞脹大，胞膜破裂，細胞內容物外溢，核變化較慢，DNA降解不充分，會引起局部嚴重的炎癥反應。
流式檢測細胞凋亡的原理
Annexin V和PI雙染法是流式檢測細胞凋亡的經典方法 ，它是基于凋亡的早期細胞膜上的磷脂酰絲an酸（phosphotidylserine, PS）從細胞膜的內側翻轉到細胞膜的表面這一原理來實現的。
凋亡早期 PS從細胞膜的內側外翻：該方法簡便、快速、準確區分活細胞、凋亡細胞和壞死細胞。因此，將Annexin V與PI聯合使用時，便可用來鑒別活細胞，凋亡細胞及死亡細胞。
數據分析
Annexin V-FITC/PI凋亡檢測試劑盒是用FITC標記的Annexin V作為探針，FITC最大激發波長為488 nm，最大發射波長525 nm，FITC的綠色熒光在FL1通道檢測；PI-DNA復合物的最大激發波長為535 nm，最大發射波長為615 nm，PI的紅色熒光在FL2或FL3通道檢測。通過軟件分析，繪制雙色散點圖，FITC為橫坐標，PI為縱坐標。
常見問題解答
1. 如何避免出現假陽性結果？
2. 為什么必須收集細胞上清？
因為凋亡的細胞可能會脫壁，懸浮于培養基，所以必須收集上清再離心取沉淀，合并胰yi酶消化下來的細胞，不然檢測出來的凋亡比例可能會減少。
3. 為什么在染色后1h內就要上機檢測？
由于細胞凋亡是一個快速的過程，建議樣品在染色后1小時之內進行分析；PI受時間的影響很大，因標記了PI后會加大細胞毒性，特別是檢測早期凋亡時，如果時間延長除了會導致在流式細胞儀上的細胞分群差距加大外，誤差會明顯加大，所以建議在一個小時內檢測。
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