質(zhì)粒克隆載體的設(shè)計和構(gòu)建的原則

①選擇合適的出發(fā)質(zhì)粒

出發(fā)質(zhì)粒也叫親本質(zhì)粒，它應(yīng)含有質(zhì)粒克隆載體bi備的元件，如復(fù)制起始位點、選擇標記基因、克隆位點、啟動子和終止子等。

②正確獲得構(gòu)建質(zhì)粒克隆載體的元件

一般采用限制性核酸內(nèi)切酶切割出質(zhì)粒DNA分子，獲得含有某種元件的DNA--片段，還可以采用PCR技術(shù)從靶DNA中擴增出含某種元件的特異性DNA--片段。

③組裝合適的選擇標記基因

構(gòu)建的質(zhì)粒克隆載體應(yīng)該組裝什么樣的選擇標記基因，必須根據(jù)要轉(zhuǎn)化的受體細胞的特性來決定。

④選擇合適的啟動子

為了構(gòu)建表達質(zhì)粒的克隆載體，必須組裝合適的啟動子，當(dāng)設(shè)計真核生物的基因須在原核生物中表達式，常改用原核生物或病毒(噬菌體)基因的啟動子，而原核生物基因在真核細胞中表達時，仍可用原核生物基因的啟動子。

質(zhì)粒載體的分類

按復(fù)制形式

分為嚴緊型和松弛型復(fù)制。

根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細胞的拷貝數(shù)的多少，可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型：嚴緊型和松弛型。嚴緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴格控制，拷貝數(shù)較小一般只有1~3個拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制宿主的控制比較松，在宿主中的拷貝數(shù)比較多，一般有10~200個拷貝，有時可達到700個。

按基因轉(zhuǎn)移性

分兩類：（1）傳遞性質(zhì)粒：常為大型、嚴緊型質(zhì)粒；

（2）非傳遞性質(zhì)粒：多為小型、松弛型質(zhì)粒。

按遺傳性狀、產(chǎn)物分類

（1）抗生素抗性：如an芐西林、氯mei素抗性；

（2）限制酶-修飾酶（R-M）系統(tǒng)：如hsdR-菌株可使DNA甲基化，但不限制外源DNA；hsd-菌株為限制和甲基化雙缺陷型。

人工構(gòu)建的質(zhì)粒載體分類

高拷貝數(shù)的質(zhì)粒載體

ColE1、pMB1派生質(zhì)粒具有高拷貝數(shù)的特點。適合大量增殖克隆基因，或需要大量表達的基因產(chǎn)物。

低拷貝數(shù)的質(zhì)粒載體

由 pSC101派生來的載體特點是分子量小的拷貝數(shù)。它有特殊的用途：當(dāng)有些被克隆的基因的表達產(chǎn)物過多時會嚴重影響寄主菌的正常代謝活動，導(dǎo)致寄主菌的死亡時，就需要低拷貝的載體。

失控的質(zhì)粒載體

這是一類溫度敏感型復(fù)制控制質(zhì)粒。如pBEU1、 pBEU2。

插入失活型克隆載體。載體的克隆位點位于其某一個選擇性標記基因內(nèi)部。如pDF41、pDF42。

正選擇的質(zhì)粒載體

直接選擇轉(zhuǎn)化后的細胞。只有帶有選擇標記基因的轉(zhuǎn)化菌細胞才能在選擇培養(yǎng)基上生長。